Den historiske perioden i Egypt begynte ved overgangen til det tredje og fjerde årtusen før Kristi fødsel. Den eldgamle kulturelle tradisjonen, som gjennomgikk påvirkning av inntrengere og interne omveltninger, varte til kristendommen ble adoptert i det fjerde århundre e. Kr. I nesten tre og et halvt tusen år har listen og funksjonene til de egyptiske gudene gjennomgått betydelige endringer. Egyptiske guder skaffet seg egenskaper og navn som er karakteristiske for sine naboer - assyrere, hettitter, hyksos, hellenere.
Etter foreningen av Egypt under styret av en enkelt hersker, gikk mange guder fra individuelle regioner og stammer i landet inn i det felles pantheonet, men de fleste av dem ble æret bare i miljøet der kulten deres oppsto. Noen guder fikk gradvis en felles egyptisk betydning. Gudinnen Bastet, som har et kattehode, vokste uten tvil ut av en kult for ære for katter som voktere av kornreserver fra mus. Landbruket spilte en stor rolle i Egyptrolle, i motsetning til for eksempel Hellas, som steg hovedsakelig på grunn av handel og militære erobringer. Antropomorfe egyptiske guder ble ofte utstyrt med hodet til et dyr, på grunnlag av æren som denne eller den kulten oppsto. For eksempel hadde guden Thoth hodet til en ibis, gudinnen Sokhmet (Sekhmet) hadde hodet til en løve, Anubis hadde hodet til en hund.
Etter hvert som visse områder av landet reiste seg, var det et skifte av dynastier eller "flytting" av hovedstaden til et nytt sted, endret også de egyptiske gudene til "det første sjiktet". Et interessant trekk ved den gamle egyptiske religionen var tilstedeværelsen av et stort antall kosmogoniske myter (det vil si versjoner av verdens opprinnelse), og i hver lokalitet spilte den lokale guddommen hovedrollen i denne vanskelige saken.
Egyptiske guder i et så stort antall, som ble grunnlaget for lokal separatisme, var uten tvil ikke nødvendig av et enkelt land. I tillegg krevde tallrike kulter utgifter til en stor mengde materielle ressurser, som kunne brukes med mye større fordel på den interne ordningen i landet, på vedlikehold av hæren, og så videre. Og med stor rikdom og innflytelse truet de presteklanene direkte faraoens makt.
Alt tatt i betraktning, introduserer farao Amenhotep IV, som tar navnet Akhenaten, kulten av en mindre regional guddom Aton (den guddommelige solskiven) som en vanlig egyptisk religion. Men tradisjonen i tradisjonen var for sterk, og Akhenaton dør før han fyller førti. I følge den mest overbevisende versjonen var han detforgiftet. Riktignok berørte ikke forfølgelsen familien, og hans kone (den berømte Nefertiti) forble i live mange år etter ektemannens død.
Etter den persiske og senere hellenske overtakelsen av landet, begynner de egyptiske gudene og gudinnene gradvis å miste sin tidligere innflytelse, faller i forfall. De smelter sammen med inntrengernes guder. For eksempel ble Alexander den store æret i Egypt som sønn av Zeus-Amon, en synkretisk egyptisk-hellenistisk guddom.
Da de egyptiske gudene, hvis navn hadde både lokal og blandet opprinnelse, begynte å vike for en ny religion – kristendommen, begynte glemselen av gammel egyptisk skrift gradvis. Under keiser Konstantins regjeringstid døde den siste bæreren av den egyptiske religiøse tradisjonen, hvoretter navnene på de gamle egyptiske gudene i mange århundrer bare var kjent fra skriftene til greske og romerske historikere. Men begge ble kjent med den egyptiske kulturen i en tid da den allerede var i ferd med å avta, og det er usannsynlig at prestene innviet fremmede (ofte aggressive) til hemmelighetene til religionen deres.
Forsøk på å tyde de eldgamle hieroglyfene ble gjort gjentatte ganger av både arabiske forskere og europeere, men til ingen nytte. Og først på begynnelsen av det nittende århundre klarte den briljante lingvisten Francois Champollion å finne nøkkelen til å tyde de egyptiske tekstene. Fra det øyeblikket begynte den moderne æraen med å studere historien og kulturen til det gamle Egypt.